El Colegio forma parte de la Obra San Luis de los Franceses, fundada por el Padre Henri de Saureulx en 1633.
Para facilitar la buena marcha de la Obra San Luis de los Franceses, el gobierno francés firmó un Tratado con el gobierno español beneficiando a la Obra de la doble protección del Estado francés y del Estado español.
Fundado en 1856 por el Rector Maurice Harriet, el Colegio San Luis de los Franceses, recibía en su origen a jóvenes franceses cuyas familias residían en Madrid. El interés por el idioma francés y por una educación esmerada hizo evolucionar el Colegio hacia la admisión de jóvenes españoles.
